本罪与非罪的界限
正确区分本罪与非罪的界限，主要应把握本罪与一般徇私低价处理国有资产行为的界限，区分的关键在于行为是否使国家利益遭受了重大损失。如果行为人低价处理国有资产的行为未使国家财产遭受重大损失，即不能以本罪定罪处罚。
本罪与职务侵占罪的界限
本罪与职务侵占罪都侵犯了本单位的财产所有权，在主观上都出于故意，但两罪是有本质区别的：
1、客观方面不同。本罪表现为徇私舞弊、低价变卖国有资产，致使国家利益遭受重大损失的行为，而职务侵占罪是公司、企业或者其他单位人员，利用职务上的便利，将本单位财产非法占为己有，数额较大的行为。
2、主体不同。本罪主体为国有公司、企业或者其上级主管部门直接负责的主管人员，而职务侵占罪主体为公司、企业或者其他单位的工作人员。
3、主观目的不同。本罪的目的是为了徇私情或私利，而职务侵占罪的目的是为了非法占有单位财产。
4、客体有所不同。本罪所侵犯的客体是国有公司、企业的财产所有权和国有资产管理制度，而职务侵占罪所侵犯的客体是本单位所有的财产。