(一)本罪与非罪的区分
本条第1款的规定，非法组织卖血罪是行为犯。但 《献血法》第18条又规定：“有下列行为之一的，由县级以上地方人民政府卫生行政部门予以取缔，没收违法所得，可以并处十万元以下的罚款;构成犯罪的，依法追究刑事责任：
(1)非法采集血液的;
(2)血站、医疗机构出售无偿献血的血液的;
(3)非法组织他人出卖血液的。”那么，如何理解两种法律规定之间的关系，对于区分罪与非罪至关重要。
(二)本罪与强迫卖血罪的界限
两罪在主体上都是一般主体，必须是年满16周岁的人才能构成;主观上都是出于故意，即明知自己行为的性质而仍然实施这种行为;客体上都直接侵犯了国家对献血工作的管理制度。但它们又有明显的不同：
(1)客体不完全相同。非法组织卖血罪没有侵犯卖血者的人身权利，而强迫卖血罪则侵犯了卖血者的人身权利。
(2)客观方面不同。非法组织卖血罪中的被组织者是自愿卖血的，而强迫卖血罪中的卖血者则是被迫的;本罪表现为组织行为，而后者表现为以暴力、威胁方法强迫的行为。
(三)本罪与非法采集、供应血液、制作、供应血液制品罪的界限
两罪都是血液方面的危害公共卫生罪，主观上都出于故意，客观方面也表现出一定的相似之处，主体都是一般主体，客体也基本相同，但二者是有明显区别的：
(1)犯罪对象不完全相同。本罪的对象只能是血液，不包括血液制品;后者的对象不仅包括血液，还包括血液制品。
(2)行为方式不同。本罪表现为将血液作为商品加以出卖而破坏无偿献血制度，后罪表现为没有采供血液资格或制作、供应血液制品的资格而非法进行采供或制作、供应而破坏采供血以及血液制品管理制度。
(3)本罪是行为犯，后者是危险犯，必须足以危害人体健康的才能构成犯罪。
(4)本罪的主体在理论上属于组织犯，后者的主体在理论上属于实行犯。